Como usar ? Por mais que sempre que se fala em linha de comando os usuários se assustem não é nada de mais ainda mais se vc já esta acostumado com a receita de bolo do ./configure && ./make a diferença é que vc não vai usar o make install pois é agora que entra o checkinstall.
exemplo:
checkinstall -R (Gerar um RPM)
checkinstall -S (Gerar um TGZ do Slackware)
checkinstall -D (Gerar um DEB)
Apos o comando, o programa pedira algumas informações sobre o pacote, podendo inclusive vc personalizar com seu nome e coisas do genero, apos isso é so estalar o programa com a ferramenta utilizado pelo sua distro.
exemplo:
dpkg -i
rpm -ivh
installpkg
Agora vc não vai precisar compilar denovo este pacote quando for estalar em outra maquina ou coisa do gênero.